Hi,
wenn Du in einem Terminal in das Programmverzeichnis wechselst und dort mit "java -jar programm.jar" das Programm bereits starten kannst, dann geht es ganz einfach, wie folgt.
Einträge im Gnome-Menü kannst Du mit alacarte bearbeiten. Im Menü: System -> Einstellungen -> Hauptmenü auswählen (Hauptmenü ist der Name des Menüeintrags, ist vielleicht etwas ungünstig gewählt).
In der Menüstruktur den Menüzweig auswählen in dem Du den Eintrag hinzufügen willst. Mit dem Knopf "Neuer Eintrag" kannst Du dann einen neuen Eintrag erstellen.
Name: der Name, der dann im Menü erscheinen soll
Befehl: java -jar /fullpath/prgramm.jar <-- wichtig ist, dass Du den kompletten Pfad bis zum programm.jar dort eingeben musst
Kommentar: ist der Tolltip, der erscheint, wenn die Maus über dem Menüeintrag verweilt
SubOptimal